Na zámku v Horní Branné poskytl on a jeho manželka Angelina Zárubová, pocházející z rakouského rodu Zelkingů, ochranu pronásledovanému Komenskému před jeho odchodem z vlasti. V té době se rozhodovalo o jeho majetku a jeho životě: roku 1623 byl Záruba odsouzen k manství za účast v protihabsburském povstání, nápadnictví (podíl z dědictví nebo jiný podíl na gruntě či městském domě) jeho majetku odkoupil Albrecht z Valdštejna. Václav Záruba i jeho manželka jsou pochováni v kostele sv. Bartoloměje v Lanžově.